Tengo hidronefrosis debido a una malformación congénita. Nací con duplicidad renal, ¿que médico

Si la función renal (creatinina en sangre) es normal debería consultar con un urólogo. La duplicidad renal no es una patología si no hay obstrucción.
Se debe realizar un seguimiento.

Si tiene hidronefrosis tiene, por definición, uropatía obstructiva. El reflujo no cursa con hidronefrosis permanente, en la ecografía solamente se ve la dilatación en el periodo en el cual el reflujo se produce. Si tuviera reflujo, su hemisistema sería muy pequeño y pobre.
Posiblemente tiene un megauréter estenótico asociado a un doble sistema (o un ureterocele). Si la función del hemisistema afectado es normal, debería solucionarse la obstrucción antes de que el riñón pierda función.
Si el hemisistema afectado no tiene función y no le da problemas, posiblemente no haya que hacer nada.
Es importante, además, conocer su edad.