Me recetaron Lopid y compré Atorvastatina. ¿Hay diferencia?

Si, no es lo mismo. El Lopid es Gemfibrozilo, une medicamento que utilizamos en los pacientes con hipertrigliceridemia, mientras que la Atorvastatina es un medicamento utilizado para la hipercolesterolemia.
Aunque la Atorvastatina puede mejorar los niveles de triglicéridos, si han recetado Lopid probablemente sea porque los tiene demasiado elevados como para esperar una respuesta suficiente con la Atorvastatina y/o porque no tiene el colesterol elevado.

Son fármacos diferentes, el Lopid es Gemfibrazilo, es un fibrato, que actúa sobre el hígado disminuyendo la producción de triglicéridos, mientras la Atorvastatina es una estatina, que actúa sobre el hígado disminuyendo la producción de colesterol.
Las indicaciones para su utilización son distintas.