¿La distimia muy prolongada es susceptible de incapacitar laboralmente al enfermo?

Pienso que no, son dificultades en el estado de ánimo (como indica su nombre);, en la mayoría de los casos, viene como consecuencia de variables de personalidad cronicas y subjetivas, si la persona pierde su actividad laboral, puede agudizar más sus pensamientos de inutilidad y retroalimentar el cuadro de vulnerabilidad emocional, entrando todavía mas en el bucle

Lo veo complicado.

La distimia como tal no tiene porque incapacitar laboralmente al enfermo ya que son síntomas leves.
En caso de que haya una agravación de los síntomas y llegue a ser altamente incapacitante estamos hablando de otro diagnostico.
Le aconsejo que acuda a un Psicólogo Sanitario para que pueda evaluar los síntomas y ver si se está produciendo una recaída o evolución hacia un trastorno de estado de animo diferente a la distimia.

Para que pueda otorgarse el diagnóstico de distimia (trastorno depresivo persistente) es necesario que se experimenten los síntomas como mínimo durante dos años (en niños y adolescentes mínimo un año). Parece ser que en la distimia no se experimentan gravedad de los síntomas como para incapacitarlo laboralmente, pero si experimenta una agudización de los mismos, se debería comprobar si cumple los criterios para el diagnóstico de depresión mayor.
Si cumple los criterios para depresión mayor se puede realizar el diagnóstico y pedir la incapacidad laboral al tribunal médico.

Aunque los síntomas de la distimia son más leves que los de una depresión mayor, sí que es posible que incapaciten laboralmente a una persona.
La dificultad suele estar más en la interferencia que la sintomatología concreta que este enfermo presente pueda suponer en sus funciones como trabajador, más que por la duración del trastorno.
Pero en cualquier caso será el médico el que decidirá, si la persona puede y debe seguir trabajando o no.